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亚愽国际app下载研究揭示线粒体基因在分子钟运用中的局限性
发表日期: 2011-08-30 作者: 文章来源:两爬室
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通过分子钟估算分歧时间是进化生物学研究中的常用手段。在实际运用中,分子标记的替换饱和常因得不到充分的模型拟合而误导结果。鉴于线粒体基因组的高演化速率,其在分子钟运用中的局限性已为众多研究者所警觉。但由于不同生物类群的演化时间跨度、可用化石标定、线粒体基因组演化速率各异,该分子标记的局限性不能一概而论。

亚愽国际app下载两栖爬行动物研究室曾晓茂研究员课题组以有尾两栖动物为例,通过对比分别基于线粒体基因组和核基因外显子估算的分歧时间,评估了在特定类群中线粒体基因高演化速率对时间估算的误导模式。结果表明,由于有尾类起源古老(2-3亿年)且缺乏涉及近期分歧事件的有效化石标定,基于线粒体基因的分子钟分析严重高估了分歧事件发生的时间。特别是较年轻的事件,可能被高估3-10倍。如类似评估在其他生物类群开展,将有利于分子钟分析的标记选择以及对其结果的理解和运用。

该研究结果近期发表在国际知名学术刊物 Molecular Biology and Evolution上(Zheng Yu-Chi *, Peng Rui, Kuro-o Masaki, Zeng Xiao-Mao*  Exploring patterns and extent of bias in estimating divergence time from mitochondrial DNA sequence data in a particular lineage: A case study of salamanders (Order Caudata). 2011, 28(9):2521-2535. )


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